Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cry1P97784 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms