Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thumpd3P97770 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms