Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bop1P97452 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bop1P97452 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bop1P97452 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms