Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps3aP97351 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms