Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mesp1P97309 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms