Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim43bP86448 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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