Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
H3f3aP84244 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3f3aP84244 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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