Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arf1P84078 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Arf1P84078 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Arf1P84078 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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