Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubg1P83887 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms