Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms