Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprn2P80560 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprn2P80560 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms