Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms