Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cux2P70298 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux2P70298 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux2P70298 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux2P70298 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cux2P70298 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms