Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PtprvP70289 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprvP70289 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms