Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp7P70280 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms