Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rad54lP70270 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms