Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Hoxd13P70217 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd13P70217 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Hoxd13P70217 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd13P70217 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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