Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna1P70206 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms