Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tubb4bP68372 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb4bP68372 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms