Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Acta1P68134 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Acta1P68134 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms