Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps17P63276 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps17P63276 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps17P63276 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps17P63276 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps17P63276 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps17P63276 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps17P63276 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps17P63276 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps17P63276 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps17P63276 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms