Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tra2bP62996 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tra2bP62996 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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