Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd1P62315 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms