Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lsm6P62313 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm6P62313 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms