Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ufm1P61961 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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