Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SnnP61807 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SnnP61807 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SnnP61807 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnnP61807 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnnP61807 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnnP61807 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnnP61807 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SnnP61807 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms