Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga11P61622 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms