Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2kP61087 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms