Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chp1P61022 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms