Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sem1P60897 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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