Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hps5P59438 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hps5P59438 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hps5P59438 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hps5P59438 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hps5P59438 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms