Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms