Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms