Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dpf3P58269 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms