Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NcstnP57716 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms