Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bace1P56818 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms