Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp5P56399 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp5P56399 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp5P56399 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms