Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms