Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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RabggtbP53612 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RabggtbP53612 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RabggtbP53612 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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