Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Map3k1P53349 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Map3k1P53349 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms