Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lbx1P52955 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lbx1P52955 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lbx1P52955 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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