Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClgnP52194 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms