Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc1a1P51906 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms