Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt2P50752 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt2P50752 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms