Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Defa6P50704 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa6P50704 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms