Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt6aP50446 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms