Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpdP50404 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms