Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmod1P49813 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms