Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epb42P49222 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epb42P49222 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epb42P49222 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epb42P49222 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb42P49222 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Epb42P49222 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epb42P49222 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Epb42P49222 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms