Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbp3P49194 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbp3P49194 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms